سیمون دوازده ساله پس از تماشای مرگ بی‌رحمانه مادرش، احساس جدایی دردناکی از دنیا دارد. سیمون، یک هنرمند چندرسانه‌ای گوشه‌گیر در دهه بیست زندگی‌اش، در تلاش است تا حملات پانیک خردکننده‌اش را کنترل کند و شغل خود را در یک پارکینگ زیرزمینی حفظ کند. و سیمون، یک فیزیک‌دان شصت ساله، در حال ارائه کنفرانسی درباره ماهیت زمان است. زندگی این سه سیمون در یک فرادنیای هزارتوگونه به هم گره می‌خورد؛ جایی که بازه‌های زمانی با هم تداخل دارند، شخصیت‌ها تکثیر می‌شوند و خطوط داستانی تکرار و گسترش می‌یابند. اما فیلم اندورفین با وجود تمام رفت‌وآمدهایش در طول زمان، همچنان در زندگی درونی سیمون‌ها ریشه دارد؛ یک بررسی هنری از پدیده‌های علمی که به شکلی تاثیرگذار به چگونگی مواجهه انسان‌ها با تروما می‌پردازد.

پانزده سال بعد، قهرمانان فیلم پاتوق شاید خودشان تغییر چندانی نکرده باشند، اما دنیای اطرافشان قطعاً تغییر کرده است! برای «گاو نر»، واقعیت بی‌رحمانه است. همسرش پس از ۳۰ سال زندگی مشترک، خسته از خیانت‌های او، تصمیم می‌گیرد او را از خانه بیرون کند. اما گاو نر که دید مثبتی به زندگی دارد، به این راحتی‌ها تسلیم نمی‌شود و برای بقای خود می‌جنگد. «شیر» نیز با جدایی مواجه می‌شود و دوست‌دخترش او را ترک می‌کند. او که کاملاً تنها شده، مجبور است دوباره هنر دلبری را یاد بگیرد. از سوی دیگر، «طاووس» با کمک یک روان‌شناس در تلاش است تا هویت جنسی خود را کشف کند. در مورد «کرم خاکی» نیز، انتظار طولانی او برای یافتن نیمه گمشده‌اش سرانجام به پایان می‌رسد.